Βαθμολογία περιόδου 1968-1969

 
 
# Ομάδα Συνολικά
Αγ. Ν-Ι-Η Γκολ Βαθ.
1 Παναθηναϊκός Παναθηναϊκός 34 26-4-4 64-16 90
2 Ολυμπιακός Ολυμπιακός 34 24-6-4 77-21 88
3 Άρης Άρης 34 17-11-6 54-33 79
4 Πανιώνιος Πανιώνιος 34 18-7-9 55-34 77
5 Π.Α.Ο.Κ. Π.Α.Ο.Κ. 34 16-10-8 58-37 76
6 Α.Ε.Κ. Α.Ε.Κ. 34 17-7-10 58-33 74
7 Αιγάλεω Αιγάλεω 34 13-10-11 48-41 70
8 Εθνικός Εθνικός 34 12-10-12 43-45 68
9 Πιερικός Πιερικός 34 11-10-13 31-37 66
10 Πανσερραϊκός Πανσερραϊκός 34 12-7-15 43-46 65
11 Ηρακλής Ηρακλής 34 12-7-15 36-39 65
12 Ο.Φ.Η. Ο.Φ.Η. 34 12-6-16 37-45 64
13 Βύζας Μεγάρων Βύζας Μεγάρων 34 12-6-16 42-53 64
14 Απόλλων Σμύρνης Απόλλων Σμύρνης 34 12-5-17 40-38 63
15 Βέροια Βέροια 34 8-12-14 34-41 62
16 Τρίκαλα Τρίκαλα 34 9-5-20 30-63 57
17 Χαλκίδα Χαλκίδα 34 7-8-19 38-61 56
18 ΑΕ Λεμεσού ΑΕ Λεμεσού 34 2-1-31 20-125 39
Αφαιρέσεις βαθμών
Α.Ε.Κ. 1 Η Α.Ε.Κ. τιμωρήθηκε με αφαίρεση ενός βαθμού διότι στις 15 Ιουνίου 1969 για την 34η αγωνιστική με αντίπαλο τον Ο.Φ.Η. αποχώρησε από το γήπεδο στο 26ο λεπτό διαμαρτυρόμενη για ένα πέναλτι που υπέδειξε υπερ του Ο.Φ.Η. ο διαιτητής κύριος Βούλγαρης.Το σκορ σε εκείνο το σημείο ήταν 0-1 υπέρ της Α.Ε.Κ. Ο αγώνας κατοχυρώθηκε στην ομάδα της Κρήτης με 2-0.