Τρόπαια και διακρίσεις

Κύπελλο Ελλάδας (16)

• 2022-2023 ( Matias Almeyda )
• 2015-2016 ( Τραϊανός Δέλλας, Στέλιος Μανωλάς, Gustavo Poyet, Νίκος Παναγιωτάρας )
• 2010-2011 ( Dusan Bajevic, Χριστόφορος Κόλα, Manolo Jimenez )
• 2001-2002 ( Fernando Santos )
• 1999-2000 ( Γιάννης Παθιακάκης, Τάκης Καραγκιοζόπουλος, Ljubisa Tumbakovic )
• 1996-1997 ( Πέτρος Ραβούσης )
• 1995-1996 ( Dusan Bajevic )
• 1982-1983 ( Helmut Senekowitsch, Κώστας Νεστορίδης, Zlatko Cajkovski )
• 1977-1978 ( Frantisek Fadrhonc, Zlatko Cajkovski, Ανδρέας Σταματιάδης )
• 1965-1966 ( Τρύφων Τζανετής )
• 1963-1964 ( Heinrich Muller )
• 1955-1956 ( Κώστας Νεγρεπόντης )
• 1949-1950 ( Jack Beby )
• 1948-1949 ( Jack Beby )
• 1938-1939 ( Κώστας Νεγρεπόντης )
• 1931-1932 ( Θέμος Ασδέρης )

Ελληνικό Super Cup (3)

• 1995-1996 ( Dusan Bajevic )
• 1988-1989 ( Dusan Bajevic )
• 1970-1971 ( Branko Stankovic )

Ελληνικό League Cup (1)

• 1989-1990 ( Dusan Bajevic )

Κύπελλο πρωταθλητριών (1)

• 1968-1969 ( Branko Stankovic )
  Προημιτελικά

Champions League (5)

• 2018-2019 ( Manolo Jimenez, Μαρίνος Ουζουνίδης )
  Φάση ομίλων
• 2006-2007 ( Lorenzo Serra Ferrer )
  Φάση ομίλων
• 2003-2004 ( Ilie Dumitrescu, Δημήτρης Μπουρουτζήκας, Dusan Bajevic )
  Φάση ομίλων
• 2002-2003 ( Dusan Bajevic )
  Φάση ομίλων
• 1994-1995 ( Dusan Bajevic )
  Φάση ομίλων

Κύπελο UEFA (1)

• 1976-1977 ( Frantisek Fadrhonc )
  Ημιτελικά

Europa League (1)

• 2017-2018 ( Manolo Jimenez )
  Φάση των 32

Κύπελλο κυπελλούχων (2)

• 1997-1998 ( Αντώνης Μήνου, Dumitru Dumitriu )
  Προημιτελικά
• 1996-1997 ( Πέτρος Ραβούσης )
  Προημιτελικά

Conference League (1)

• 2021-2022 ( Vladan Milojevic, Αργύρης Γιαννίκης, Σωκράτης Οφρυδόπουλος )
  Δεύτερος προκριματικός γύρος